荧光显微镜用于研究细胞内物质的吸收、运输、化学物质的分布及定位等。细胞中有些物质，如叶绿素等，受紫外线照射后可发荧光;另有一些物质本身虽不能发荧光，但如果用荧光染料或荧光抗体染色后，经紫外线照射亦可发荧光，荧光显微镜就是对这类物质进行定性和定量研究的工具之一。

　　使用方法：

　　(1)打开灯源，超高压汞灯要预热15min才能达到最亮点。

　　(2)显微镜需在光源与暗视野聚光器之间装上所要求的激发滤片，在物镜的后面装上相应的压制滤片。荧光显微镜需在光路的插槽中插入所要求的激发滤片、双色束分离器、压制滤片的插块。

　　(3)用低倍镜观察，根据不同型号显微镜的调节装置，调整光源中心，使其位于整个照明光斑的中央。

　　(4)放置标本片，调焦后即可观察。使用中应注意:未装滤光片不要用眼直接观察，以免引起眼的损伤;用油镜观察标本时，必须用无荧光的特殊镜油;高压汞灯关闭后不能立即重新打开，需待汞灯*冷却后才能再启动，否则会不稳定，影响汞灯寿命。

　　(5)观察。例如:在显微镜下用蓝紫光滤光片，观察到经0.01%吖啶橙荧光染料染色的细胞，细胞核和细胞质被激发产生两种不同颜色的荧光(暗绿色和橙红色)。